1、鼠标右键点击u盘，然后点击“属性”，如图：
 

　　
2、在弹出的窗口中点击“工具”选项卡，在“查错”栏点击“开始检查”，如图：
 

　　
3、在弹出的检查磁盘窗口中将“自动修复文件系统错误”和“扫描并尝试恢复坏扇区”前选项都勾选，然后点击“开始”进行扫描，如图：
 

　　
U盘中的数据检查并修复之后，就可以删除空文件夹了，如果还是不行，那么只能将有用的文件拷贝出来，再格式化，再把文件拷贝回去。